| 年度 | 项目名称 | 获奖层次 | 获奖人员 |
| 2003 | 五藤胶囊治疗类风湿性关节炎、强直性脊柱炎的临床应用 | 南通市卫生局优秀项目二等奖 | 马小平 |
| 2006 | 五藤胶囊治疗强直性脊柱炎的临床研究 | 南通市科学技术进步奖三等奖 | 马小平，名次：第一名 |
| 2006 | 五藤胶囊治疗强直性脊柱炎的临床研究 | 海安县科学技术进步奖一等奖 | 马小平 |
| 2011 | 头体二联针法治疗椎动脉型颈椎病临床疗效研究 | 南通市科技进步奖二等奖 | 马小平、季瑜、高广忠、陈安、储兰芳、鲁厚林、练剑锋 |
| 2011 | 耳穴特异性的临床研究 | 江苏中医药科学技术奖二等奖 | 马小平 |
| 2015 | 火针靶点焠刺法治疗类风湿关节炎关节畸形的临床应用 | 南通市优秀中医药项目三等奖 | 马小平 |